叙例言上卷人身阴阳五脏所生五脏所属五脏所藏五脏所主脏腑所合脏腑之官五藏九窍男女天癸血气所生营卫生会六经六气经气主治十二经脉冲任督带下卷全体总论五脏所伤五脏所恶脏腑为病诸病所属四时所病脏腑通治望形察色闻
卷一九针十二原第一（法天）本输第二（法地）小针解第三（法人）邪气脏腑病形第四（法时）卷二根结第五（法音）寿夭刚柔第六（法律）官针第七（法星）本神第八（法风）终始第九（法野）卷三经脉第十经别第十一经水第
序引补剂用药中风咳嗽吐血中暑痢疾阴症老人妇人小儿外科治法制剂煎药服药法延医秘方诡诞宗传跋
茧唇一口疮二齿痛三舌症四喉痹诸症五喉痛六诸骨稻谷发鲠七治诸鲠咒法八误吞水蛭九诸虫入耳十蛇入七窍及虫咬伤十一男女体气十二附方并注
《神农本草经》简介邵序张序孙序周序上经（上品）玉石丹沙云母玉泉石钟乳涅石消石朴消滑石石胆空青曾青禹余粮太乙余粮白石英紫石英青石、赤石、黄石、白石、黑石脂等白青扁青草菖蒲鞠华人参天门冬甘草干地黄术菟丝子
《评琴书屋医略》提要自叙凡例序附诗并各题赠卷一外感症春日外感夏日外感秋日外感冬日外感春温症(冬温同论症治)暑症附案(暑邪变疟)湿症泄泻症痢症附论时行传染二症疟症附案(暑邪变疟)又案(疟后辨寒热)卷二消
脏腑经络先后病脉证治第一湿病脉证第二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证治第五血痹虚劳病脉证治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七奔豚气病脉证治第八胸痹心痛短气病脉证治第九腹满寒疝宿食病
卷第一治伤寒时气、温疫初起方治疫气伤寒，三日以后不解者方治伤寒中风方治伤寒汗出不解如疟方治伤寒胸闷、腹满方治伤寒后呕恶不食虚羸方治伤寒后烦渴及口干方治伤寒后下利脓血及发斑方治伤寒鼻衄、喉痛、疮方治伤寒
《续编》序卷上赤石脂栝楼根蜀漆生姜卷下桃仁巴豆蜜虫虻虫阿胶粳米小麦大麦粉赤小豆胶饴酒醇酒清酒法醋苦酒美酒酰白酒浆水清浆水白饮饮暖水沸汤麻沸汤鸡子白鸡子黄鸡屎白马通汁猪膏猪脂猪肤猪胆獭肝羊胆羊肉蜘蛛蛴螬
叙万氏幼科源流序卷之一形气发微论原病论入门审候歌观面部五脏形歌观面部五色歌三关脉纹变见歌小儿正诀指南赋胎疾脐风变蒸变蒸兼证幼疾五脏诸证肝经主病肝经兼证肝所生病急慢惊风急惊风有三因卷之二急惊风证急惊风变