自序卷之一治法通论养血抑气抑气养血理气活血消积理气行血理气和血养血润燥温经之剂气血攻补备焉温经涩脱温经养血温经理气和血和血温经温经理气涩脱燥湿治错杂之邪攻积卷之一调经门经候总论辨色审多少先期后期调经平
述古斋医书叙叙二叙三叙四叙五凡例卷一·辨证觇神气审形色诊面察眼察耳察唇口察齿察鼻准验舌苔诊指纹察手足听声按胸腹询溲便候脉卷二·立法按法摩法掐法揉法推法运法搓法摇法汗法吐法下法针法灸法法砭法浴法法疏表法
序凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十附录附录
曹序自序序例卷之一·阴阳脏腑部阴阳五脏卷之二·阴阳脏腑部诊法通论诊虚实法、诊寒热法（俱入治法）诊病传变（诊病将死期入诊生死条）诊病愈剧诊生死诸脉诊病杂法诊一岁病证相同卷之三·阴阳脏腑部治法通论倒仓法药
小引卷一水部诸水火部诸火土部诸土金部金赤铜铜青自然铜古文钱铅铅粉铅丹密陀僧锡铁落针砂铁精铁锈石部玉云母白石英紫石英丹砂银朱水银轻粉灵砂雄黄雌黄石膏滑石赤石脂炉甘石无名异石钟乳锻石浮石阳起石磁石代赭石禹
简介自序东洞先生著述书日记卷上卷中卷下跋《药征续编》序卷上卷下《药征续编》附录《药征续编》附言十七则
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
陈序童序自序增补本草备要自序本草备要凡例药性总义内容草部黄甘草人参沙参丹参元参白术苍术葳蕤黄精狗脊石斛远志石菖蒲牛膝甘菊花五味子天门冬麦门冬款冬花紫菀旋复花百部桔梗荠马兜铃白前白芨半夏天南星贝母栝楼仁
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扁鹊神应鍼灸玉龙经