自序序论脏象论经络次序论经络浅深论奇经八脉论总论宗气论营气论卫气论脉诀论病因论中风论八风论轻重论寒热论证候论风脉论治法论药饵附案
小引凡例卷上补可扶弱四君子汤六君子汤香砂六君子汤五味异功散香砂六君子汤论补中益气汤当归补血汤保元汤独参汤四物汤八珍汤十全大补汤人参养荣汤天王补心丹六味地黄丸桂附地黄丸还少丹龟鹿二仙胶圣愈汤十味地黄丸正
洄溪医案
序序刻孙真人眼科秘诀序卷之一孙真人眼科总理七十二症秘诀冲和汤玄灵圣方制炉甘石药开明汤十大将军冲翳散揭障丹十二将军二圣散论二圣散扫雾丹制蕤仁之法大决明散赛宝丹调合赛宝丹法补脑还精丸外治烂弦迎风有泪方卷之
病机气宜保命集
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
序自序辨病源第一辨经络第二辨色第三辨脉第四辨手太阴本病症治第五辨手少阳标病第六辨手少阴标病第七辨三经标本并病第八辨救误上第九辨救误下第十辨善后第十一辨外治第十二辨禁忌第十三辨张氏无治之症第十四辨耐修药
奇经八脉总说八脉阴维脉阳维脉二维为病阴跷脉阳跷脉二跷为病冲脉冲脉为病任脉任脉为病督脉督脉为病带脉带脉为病气口九道脉释音
简介序叙凡例正文
修订说明写在卷首诊脉传心诀诸脉主病诊脉总要诊脉六法三部总看歌发言须当理引经药用药传心赋治病主药诀四君汤加减歌四物汤加减歌二陈汤加减歌小柴胡汤加减歌平胃散加减歌病因赋百病皆生于六气诸症莫逃乎四因伤寒症传