叙卷一·琼瑶神书天部宋徽宗皇帝崇宁五年琼瑶真人一书手法序一琼瑶真人用升阳升阴气上气下之手法讲论歌二琼瑶标本运气歌三琼瑶辨十二经水火分治法四宋徽宗崇宁皇帝论五论手足阴阳流注篇六络脉传注周流不息七琼瑶真人
序医治整理补接次第口诀又治伤损方论
吴序正文原始论疹脉辨症初热疹治合时见形论治收没论治分论麻疹始终杂症发热身冷咳嗽气喘气促呕吐吐下蛔虫烦渴谵妄发搐饮食目疾鼻症口舌牙喉病论汗腹痛泄泻痢疾大小便闭沉睡麻疳妊娠出疹盖痘疹瘾疹禁忌麻疹备用诸方
第1部分第2部分
序论痘疹受病之由论痘疹治法类集痘疹已效名方附方附：
金匮方歌括
简介序凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七
序卷一论疮疡二十六脉所主（一）论疮疡五善七恶主治（二）论疮疡当明本末虚实（三）论疮疡用针宜禁（四）论疮疡欲呕作呕（五）论疮疡用汗下药（六）论疮疡围寒凉之药（七）论疮疡泥用定痛散（八）论疮疡用生肌之药（
余无言医案及医话
卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论